Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZJ7

Ric1, RAB6A-GEF complex partner protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ric1Q69ZJ7 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ric1Q69ZJ7 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ric1Q69ZJ7 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ric1Q69ZJ7 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ric1Q69ZJ7 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ric1Q69ZJ7 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ric1Q69ZJ7 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ric1Q69ZJ7 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ric1Q69ZJ7 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ric1Q69ZJ7 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ric1Q69ZJ7 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ric1Q69ZJ7 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ric1Q69ZJ7 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ric1Q69ZJ7 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ric1Q69ZJ7 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ric1Q69ZJ7 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ric1Q69ZJ7 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ric1Q69ZJ7 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ric1Q69ZJ7 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ric1Q69ZJ7 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ric1Q69ZJ7 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ric1Q69ZJ7 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ric1Q69ZJ7 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ric1Q69ZJ7 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ric1Q69ZJ7 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ric1Q69ZJ7 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ric1Q69ZJ7 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ric1Q69ZJ7 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ric1Q69ZJ7 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ric1Q69ZJ7 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ric1Q69ZJ7 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ric1Q69ZJ7 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ric1Q69ZJ7 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ric1Q69ZJ7 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ric1Q69ZJ7 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ric1Q69ZJ7 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ric1Q69ZJ7 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ric1Q69ZJ7 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ric1Q69ZJ7 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ric1Q69ZJ7 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ric1Q69ZJ7 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ric1Q69ZJ7 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ric1Q69ZJ7 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ric1Q69ZJ7 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ric1Q69ZJ7 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ric1Q69ZJ7 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ric1Q69ZJ7 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ric1Q69ZJ7 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ric1Q69ZJ7 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ric1Q69ZJ7 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ric1Q69ZJ7 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ric1Q69ZJ7 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ric1Q69ZJ7 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ric1Q69ZJ7 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ric1Q69ZJ7 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ric1Q69ZJ7 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ric1Q69ZJ7 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ric1Q69ZJ7 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ric1Q69ZJ7 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ric1Q69ZJ7 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ric1Q69ZJ7 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ric1Q69ZJ7 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ric1Q69ZJ7 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ric1Q69ZJ7 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ric1Q69ZJ7 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ric1Q69ZJ7 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ric1Q69ZJ7 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ric1Q69ZJ7 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ric1Q69ZJ7 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ric1Q69ZJ7 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ric1Q69ZJ7 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ric1Q69ZJ7 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ric1Q69ZJ7 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ric1Q69ZJ7 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ric1Q69ZJ7 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ric1Q69ZJ7 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ric1Q69ZJ7 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ric1Q69ZJ7 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ric1Q69ZJ7 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ric1Q69ZJ7 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ric1Q69ZJ7 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ric1Q69ZJ7 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ric1Q69ZJ7 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ric1Q69ZJ7 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ric1Q69ZJ7 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ric1Q69ZJ7 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ric1Q69ZJ7 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ric1Q69ZJ7 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ric1Q69ZJ7 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ric1Q69ZJ7 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ric1Q69ZJ7 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ric1Q69ZJ7 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ric1Q69ZJ7 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ric1Q69ZJ7 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ric1Q69ZJ7 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ric1Q69ZJ7 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ric1Q69ZJ7 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ric1Q69ZJ7 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ric1Q69ZJ7 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ric1Q69ZJ7 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms