Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZI1

Sh3rf1, E3 ubiquitin-protein ligase SH3RF1, mousemouse

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Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3rf1Q69ZI1 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Sh3rf1Q69ZI1 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Sh3rf1Q69ZI1 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Sh3rf1Q69ZI1 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Sh3rf1Q69ZI1 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Sh3rf1Q69ZI1 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Sh3rf1Q69ZI1 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Sh3rf1Q69ZI1 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Sh3rf1Q69ZI1 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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