Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZF8

Msl2, E3 ubiquitin-protein ligase MSL2, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl2Q69ZF8 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Msl2Q69ZF8 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Msl2Q69ZF8 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Msl2Q69ZF8 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Msl2Q69ZF8 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Msl2Q69ZF8 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Msl2Q69ZF8 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Msl2Q69ZF8 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Msl2Q69ZF8 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Msl2Q69ZF8 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Msl2Q69ZF8 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Msl2Q69ZF8 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Msl2Q69ZF8 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Msl2Q69ZF8 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Msl2Q69ZF8 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Msl2Q69ZF8 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Msl2Q69ZF8 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Msl2Q69ZF8 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Msl2Q69ZF8 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Msl2Q69ZF8 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Msl2Q69ZF8 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Msl2Q69ZF8 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Msl2Q69ZF8 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Msl2Q69ZF8 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Msl2Q69ZF8 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Msl2Q69ZF8 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Msl2Q69ZF8 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Msl2Q69ZF8 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Msl2Q69ZF8 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Msl2Q69ZF8 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Msl2Q69ZF8 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Msl2Q69ZF8 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Msl2Q69ZF8 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Msl2Q69ZF8 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Msl2Q69ZF8 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Msl2Q69ZF8 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Msl2Q69ZF8 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Msl2Q69ZF8 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Msl2Q69ZF8 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Msl2Q69ZF8 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Msl2Q69ZF8 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Msl2Q69ZF8 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Msl2Q69ZF8 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Msl2Q69ZF8 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Msl2Q69ZF8 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Msl2Q69ZF8 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Msl2Q69ZF8 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Msl2Q69ZF8 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Msl2Q69ZF8 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Msl2Q69ZF8 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Msl2Q69ZF8 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Msl2Q69ZF8 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Msl2Q69ZF8 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Msl2Q69ZF8 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Msl2Q69ZF8 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Msl2Q69ZF8 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Msl2Q69ZF8 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Msl2Q69ZF8 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Msl2Q69ZF8 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Msl2Q69ZF8 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Msl2Q69ZF8 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Msl2Q69ZF8 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Msl2Q69ZF8 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Msl2Q69ZF8 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Msl2Q69ZF8 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Msl2Q69ZF8 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Msl2Q69ZF8 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Msl2Q69ZF8 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Msl2Q69ZF8 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Msl2Q69ZF8 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Msl2Q69ZF8 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Msl2Q69ZF8 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Msl2Q69ZF8 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Msl2Q69ZF8 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Msl2Q69ZF8 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Msl2Q69ZF8 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Msl2Q69ZF8 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Msl2Q69ZF8 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Msl2Q69ZF8 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Msl2Q69ZF8 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Msl2Q69ZF8 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Msl2Q69ZF8 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Msl2Q69ZF8 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Msl2Q69ZF8 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Msl2Q69ZF8 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Msl2Q69ZF8 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Msl2Q69ZF8 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Msl2Q69ZF8 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Msl2Q69ZF8 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Msl2Q69ZF8 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Msl2Q69ZF8 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Msl2Q69ZF8 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Msl2Q69ZF8 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Msl2Q69ZF8 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Msl2Q69ZF8 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Msl2Q69ZF8 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Msl2Q69ZF8 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Msl2Q69ZF8 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Msl2Q69ZF8 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Msl2Q69ZF8 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms