Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg9aQ68FE2 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms