Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Trim24Q64127 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
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Trim24Q64127 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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