Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rbm38Q62176 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Rbm38Q62176 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Rbm38Q62176 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Rbm38Q62176 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Rbm38Q62176 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Rbm38Q62176 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Rbm38Q62176 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Rbm38Q62176 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Rbm38Q62176 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
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Rbm38Q62176 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Rbm38Q62176 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Rbm38Q62176 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Rbm38Q62176 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Rbm38Q62176 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Rbm38Q62176 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Rbm38Q62176 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
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