Protein–RNA interactions for Protein: Q61666

Hira, Protein HIRA, mousemouse

Predictions only

Length 1,015 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HiraQ61666 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HiraQ61666 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HiraQ61666 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HiraQ61666 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HiraQ61666 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HiraQ61666 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HiraQ61666 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HiraQ61666 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HiraQ61666 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
HiraQ61666 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HiraQ61666 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HiraQ61666 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HiraQ61666 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HiraQ61666 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HiraQ61666 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
HiraQ61666 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HiraQ61666 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HiraQ61666 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HiraQ61666 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
HiraQ61666 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HiraQ61666 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HiraQ61666 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HiraQ61666 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HiraQ61666 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HiraQ61666 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HiraQ61666 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HiraQ61666 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HiraQ61666 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
HiraQ61666 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
HiraQ61666 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
HiraQ61666 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HiraQ61666 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HiraQ61666 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HiraQ61666 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HiraQ61666 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HiraQ61666 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HiraQ61666 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HiraQ61666 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms