Protein–RNA interactions for Protein: Q61371

Ift88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, mousemouse

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Length 824 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift88Q61371 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Ift88Q61371 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ift88Q61371 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ift88Q61371 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ift88Q61371 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ift88Q61371 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ift88Q61371 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ift88Q61371 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ift88Q61371 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ift88Q61371 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ift88Q61371 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ift88Q61371 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ift88Q61371 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ift88Q61371 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ift88Q61371 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ift88Q61371 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ift88Q61371 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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