Protein–RNA interactions for Protein: Q61216

Mre11, Double-strand break repair protein MRE11, mousemouse

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Length 706 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mre11Q61216 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mre11Q61216 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mre11Q61216 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mre11Q61216 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Mre11Q61216 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mre11Q61216 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mre11Q61216 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Mre11Q61216 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mre11Q61216 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mre11Q61216 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mre11Q61216 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mre11Q61216 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Mre11Q61216 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mre11Q61216 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Mre11Q61216 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Mre11Q61216 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mre11Q61216 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mre11Q61216 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Mre11Q61216 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mre11Q61216 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mre11Q61216 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mre11Q61216 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mre11Q61216 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mre11Q61216 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mre11Q61216 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Mre11Q61216 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mre11Q61216 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mre11Q61216 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mre11Q61216 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mre11Q61216 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mre11Q61216 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mre11Q61216 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mre11Q61216 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mre11Q61216 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mre11Q61216 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mre11Q61216 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mre11Q61216 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Mre11Q61216 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mre11Q61216 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mre11Q61216 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Mre11Q61216 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mre11Q61216 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Mre11Q61216 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mre11Q61216 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mre11Q61216 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mre11Q61216 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mre11Q61216 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms