Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3Q61124 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Cln3Q61124 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Cln3Q61124 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Cln3Q61124 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
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Cln3Q61124 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cln3Q61124 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cln3Q61124 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cln3Q61124 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cln3Q61124 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cln3Q61124 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
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