Protein–RNA interactions for Protein: Q60829

Ppp1r1b, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r1bQ60829 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppp1r1bQ60829 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms