Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Gm37631-201ENSMUST00000192275 364 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Gm38250-202ENSMUST00000195108 462 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 AC159205.7-201ENSMUST00000225988 692 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Gm15271-201ENSMUST00000134627 2110 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mkrn3Q60764 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mkrn3Q60764 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mkrn3Q60764 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mkrn3Q60764 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mkrn3Q60764 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mkrn3Q60764 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mkrn3Q60764 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mkrn3Q60764 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mkrn3Q60764 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mkrn3Q60764 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Mkrn3Q60764 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Mkrn3Q60764 Esd-ps-201ENSMUST00000170684 847 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mkrn3Q60764 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mkrn3Q60764 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mkrn3Q60764 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Mkrn3Q60764 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Mkrn3Q60764 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mkrn3Q60764 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mkrn3Q60764 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mkrn3Q60764 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mkrn3Q60764 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mkrn3Q60764 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mkrn3Q60764 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms