Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Csnk2a1Q60737 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Csnk2a1Q60737 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Csnk2a1Q60737 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Csnk2a1Q60737 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Csnk2a1Q60737 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Csnk2a1Q60737 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Csnk2a1Q60737 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Csnk2a1Q60737 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Csnk2a1Q60737 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Csnk2a1Q60737 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Csnk2a1Q60737 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Csnk2a1Q60737 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Csnk2a1Q60737 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Csnk2a1Q60737 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Csnk2a1Q60737 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Csnk2a1Q60737 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Csnk2a1Q60737 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Csnk2a1Q60737 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Csnk2a1Q60737 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Csnk2a1Q60737 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Csnk2a1Q60737 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Csnk2a1Q60737 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Csnk2a1Q60737 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Csnk2a1Q60737 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Csnk2a1Q60737 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Csnk2a1Q60737 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Csnk2a1Q60737 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Csnk2a1Q60737 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Csnk2a1Q60737 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Csnk2a1Q60737 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Csnk2a1Q60737 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Csnk2a1Q60737 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Csnk2a1Q60737 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Csnk2a1Q60737 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Csnk2a1Q60737 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Csnk2a1Q60737 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Csnk2a1Q60737 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Csnk2a1Q60737 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Csnk2a1Q60737 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Csnk2a1Q60737 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Csnk2a1Q60737 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Csnk2a1Q60737 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Csnk2a1Q60737 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Csnk2a1Q60737 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnk2a1Q60737 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnk2a1Q60737 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnk2a1Q60737 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnk2a1Q60737 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnk2a1Q60737 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnk2a1Q60737 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnk2a1Q60737 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnk2a1Q60737 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnk2a1Q60737 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnk2a1Q60737 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnk2a1Q60737 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnk2a1Q60737 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnk2a1Q60737 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnk2a1Q60737 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnk2a1Q60737 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnk2a1Q60737 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnk2a1Q60737 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnk2a1Q60737 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnk2a1Q60737 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnk2a1Q60737 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnk2a1Q60737 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnk2a1Q60737 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnk2a1Q60737 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnk2a1Q60737 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnk2a1Q60737 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnk2a1Q60737 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnk2a1Q60737 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnk2a1Q60737 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnk2a1Q60737 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnk2a1Q60737 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnk2a1Q60737 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnk2a1Q60737 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnk2a1Q60737 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnk2a1Q60737 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnk2a1Q60737 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnk2a1Q60737 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnk2a1Q60737 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnk2a1Q60737 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnk2a1Q60737 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnk2a1Q60737 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnk2a1Q60737 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnk2a1Q60737 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csnk2a1Q60737 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnk2a1Q60737 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnk2a1Q60737 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnk2a1Q60737 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnk2a1Q60737 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnk2a1Q60737 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnk2a1Q60737 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnk2a1Q60737 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnk2a1Q60737 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnk2a1Q60737 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnk2a1Q60737 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnk2a1Q60737 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csnk2a1Q60737 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms