Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Samhd1Q60710 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samhd1Q60710 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samhd1Q60710 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samhd1Q60710 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samhd1Q60710 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samhd1Q60710 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samhd1Q60710 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samhd1Q60710 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samhd1Q60710 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samhd1Q60710 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samhd1Q60710 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samhd1Q60710 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samhd1Q60710 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samhd1Q60710 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samhd1Q60710 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samhd1Q60710 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samhd1Q60710 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samhd1Q60710 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samhd1Q60710 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samhd1Q60710 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samhd1Q60710 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samhd1Q60710 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samhd1Q60710 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samhd1Q60710 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samhd1Q60710 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samhd1Q60710 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samhd1Q60710 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samhd1Q60710 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samhd1Q60710 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samhd1Q60710 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samhd1Q60710 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samhd1Q60710 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Samhd1Q60710 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samhd1Q60710 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samhd1Q60710 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samhd1Q60710 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Samhd1Q60710 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samhd1Q60710 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Samhd1Q60710 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Samhd1Q60710 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samhd1Q60710 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Samhd1Q60710 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Samhd1Q60710 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Samhd1Q60710 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samhd1Q60710 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Samhd1Q60710 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samhd1Q60710 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samhd1Q60710 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samhd1Q60710 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samhd1Q60710 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samhd1Q60710 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samhd1Q60710 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samhd1Q60710 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samhd1Q60710 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samhd1Q60710 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samhd1Q60710 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Samhd1Q60710 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samhd1Q60710 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Samhd1Q60710 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Samhd1Q60710 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Samhd1Q60710 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Samhd1Q60710 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Samhd1Q60710 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Samhd1Q60710 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Samhd1Q60710 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Samhd1Q60710 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Samhd1Q60710 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Samhd1Q60710 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Samhd1Q60710 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Samhd1Q60710 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Samhd1Q60710 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Samhd1Q60710 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Samhd1Q60710 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Samhd1Q60710 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Samhd1Q60710 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Samhd1Q60710 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Samhd1Q60710 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Samhd1Q60710 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Samhd1Q60710 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Samhd1Q60710 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Samhd1Q60710 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Samhd1Q60710 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Samhd1Q60710 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Samhd1Q60710 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Samhd1Q60710 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Samhd1Q60710 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Samhd1Q60710 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Samhd1Q60710 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Samhd1Q60710 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Samhd1Q60710 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Samhd1Q60710 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Samhd1Q60710 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Samhd1Q60710 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms