Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Foxd4Q60688 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Foxd4Q60688 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Foxd4Q60688 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Foxd4Q60688 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Foxd4Q60688 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Foxd4Q60688 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Foxd4Q60688 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Foxd4Q60688 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Foxd4Q60688 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Foxd4Q60688 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Foxd4Q60688 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Foxd4Q60688 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Foxd4Q60688 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Foxd4Q60688 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Foxd4Q60688 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxd4Q60688 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxd4Q60688 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxd4Q60688 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxd4Q60688 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxd4Q60688 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxd4Q60688 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxd4Q60688 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxd4Q60688 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxd4Q60688 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxd4Q60688 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxd4Q60688 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxd4Q60688 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxd4Q60688 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Foxd4Q60688 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxd4Q60688 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxd4Q60688 9330185C12Rik-201ENSMUST00000180837 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxd4Q60688 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxd4Q60688 Gm28054-201ENSMUST00000187280 872 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxd4Q60688 Gm20918-202ENSMUST00000188637 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxd4Q60688 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Foxd4Q60688 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxd4Q60688 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Foxd4Q60688 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Foxd4Q60688 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxd4Q60688 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxd4Q60688 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxd4Q60688 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxd4Q60688 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxd4Q60688 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxd4Q60688 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxd4Q60688 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxd4Q60688 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxd4Q60688 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxd4Q60688 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxd4Q60688 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxd4Q60688 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxd4Q60688 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxd4Q60688 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Foxd4Q60688 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxd4Q60688 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Foxd4Q60688 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Foxd4Q60688 Gm16617-201ENSMUST00000181008 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Foxd4Q60688 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Foxd4Q60688 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Foxd4Q60688 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Foxd4Q60688 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Foxd4Q60688 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Foxd4Q60688 Defb12-201ENSMUST00000062113 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Foxd4Q60688 Gm6578-201ENSMUST00000080891 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Foxd4Q60688 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Foxd4Q60688 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Foxd4Q60688 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Foxd4Q60688 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Foxd4Q60688 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Foxd4Q60688 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Foxd4Q60688 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Foxd4Q60688 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Foxd4Q60688 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Foxd4Q60688 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Foxd4Q60688 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Foxd4Q60688 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Foxd4Q60688 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Foxd4Q60688 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Foxd4Q60688 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Foxd4Q60688 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Foxd4Q60688 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Foxd4Q60688 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Foxd4Q60688 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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