Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Psme4Q5SSW2 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms