Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPL2

Phf12, PHD finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf12Q5SPL2 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Gm20239-201ENSMUST00000196610 982 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Ly96-201ENSMUST00000026881 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Milr1-202ENSMUST00000106794 1514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Gm12752-201ENSMUST00000121657 811 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Gm20822-202ENSMUST00000188422 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Gm20828-202ENSMUST00000190516 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Gm31831-201ENSMUST00000196240 684 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Gm34272-201ENSMUST00000208886 253 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Tpt1-ps4-201ENSMUST00000210908 503 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms