Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fam208bQ5DTT3 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fam208bQ5DTT3 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms