Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Shank3Q4ACU6 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms