Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Fam220aQ3ZN08 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Fam220aQ3ZN08 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Fam220aQ3ZN08 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Fam220aQ3ZN08 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Fam220aQ3ZN08 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Fam220aQ3ZN08 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Fam220aQ3ZN08 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Fam220aQ3ZN08 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Fam220aQ3ZN08 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Fam220aQ3ZN08 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Fam220aQ3ZN08 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fam220aQ3ZN08 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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