Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms