Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT54

Obox3, Oocyte-specific homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox3Q3UT54 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Obox3Q3UT54 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Obox3Q3UT54 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Obox3Q3UT54 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Obox3Q3UT54 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Obox3Q3UT54 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Obox3Q3UT54 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Obox3Q3UT54 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Obox3Q3UT54 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Obox3Q3UT54 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Obox3Q3UT54 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Obox3Q3UT54 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Obox3Q3UT54 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Obox3Q3UT54 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Obox3Q3UT54 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Obox3Q3UT54 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Obox3Q3UT54 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Obox3Q3UT54 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Obox3Q3UT54 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Obox3Q3UT54 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Obox3Q3UT54 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Obox3Q3UT54 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Obox3Q3UT54 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Obox3Q3UT54 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Obox3Q3UT54 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Obox3Q3UT54 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Obox3Q3UT54 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Obox3Q3UT54 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Obox3Q3UT54 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Obox3Q3UT54 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Obox3Q3UT54 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Obox3Q3UT54 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Obox3Q3UT54 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Obox3Q3UT54 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Obox3Q3UT54 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Obox3Q3UT54 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Obox3Q3UT54 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Obox3Q3UT54 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Obox3Q3UT54 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Obox3Q3UT54 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Obox3Q3UT54 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Obox3Q3UT54 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Obox3Q3UT54 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Obox3Q3UT54 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Obox3Q3UT54 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Obox3Q3UT54 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Obox3Q3UT54 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Obox3Q3UT54 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Obox3Q3UT54 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Obox3Q3UT54 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Obox3Q3UT54 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Obox3Q3UT54 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Obox3Q3UT54 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Obox3Q3UT54 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Obox3Q3UT54 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Obox3Q3UT54 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Obox3Q3UT54 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Obox3Q3UT54 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Obox3Q3UT54 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Obox3Q3UT54 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Obox3Q3UT54 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Obox3Q3UT54 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Obox3Q3UT54 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Obox3Q3UT54 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Obox3Q3UT54 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Obox3Q3UT54 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Obox3Q3UT54 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Obox3Q3UT54 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Obox3Q3UT54 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Obox3Q3UT54 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Obox3Q3UT54 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Obox3Q3UT54 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Obox3Q3UT54 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Obox3Q3UT54 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Obox3Q3UT54 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Obox3Q3UT54 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Obox3Q3UT54 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Obox3Q3UT54 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Obox3Q3UT54 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Obox3Q3UT54 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Obox3Q3UT54 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Obox3Q3UT54 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Obox3Q3UT54 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Obox3Q3UT54 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Obox3Q3UT54 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Obox3Q3UT54 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Obox3Q3UT54 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Obox3Q3UT54 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Obox3Q3UT54 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Obox3Q3UT54 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Obox3Q3UT54 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Obox3Q3UT54 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Obox3Q3UT54 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Obox3Q3UT54 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Obox3Q3UT54 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Obox3Q3UT54 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Obox3Q3UT54 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Obox3Q3UT54 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Obox3Q3UT54 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Obox3Q3UT54 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms