Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm28047Q3US59 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms