Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms