Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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