Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms