Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
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Nkx6-3Q3UHX8 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
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Nkx6-3Q3UHX8 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
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Nkx6-3Q3UHX8 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nkx6-3Q3UHX8 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Nkx6-3Q3UHX8 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
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Nkx6-3Q3UHX8 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nkx6-3Q3UHX8 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Nkx6-3Q3UHX8 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Nkx6-3Q3UHX8 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Nkx6-3Q3UHX8 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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