Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

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Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ulk3Q3U3Q1 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ulk3Q3U3Q1 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ulk3Q3U3Q1 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ulk3Q3U3Q1 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ulk3Q3U3Q1 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ulk3Q3U3Q1 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ulk3Q3U3Q1 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ulk3Q3U3Q1 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ulk3Q3U3Q1 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ulk3Q3U3Q1 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ulk3Q3U3Q1 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ulk3Q3U3Q1 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ulk3Q3U3Q1 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ulk3Q3U3Q1 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ulk3Q3U3Q1 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ulk3Q3U3Q1 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ulk3Q3U3Q1 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ulk3Q3U3Q1 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ulk3Q3U3Q1 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ulk3Q3U3Q1 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ulk3Q3U3Q1 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ulk3Q3U3Q1 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ulk3Q3U3Q1 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ulk3Q3U3Q1 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ulk3Q3U3Q1 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ulk3Q3U3Q1 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ulk3Q3U3Q1 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ulk3Q3U3Q1 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ulk3Q3U3Q1 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ulk3Q3U3Q1 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ulk3Q3U3Q1 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ulk3Q3U3Q1 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ulk3Q3U3Q1 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ulk3Q3U3Q1 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ulk3Q3U3Q1 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ulk3Q3U3Q1 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ulk3Q3U3Q1 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ulk3Q3U3Q1 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ulk3Q3U3Q1 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ulk3Q3U3Q1 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Ulk3Q3U3Q1 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
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Ulk3Q3U3Q1 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Ulk3Q3U3Q1 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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