Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms