Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdnep1Q3TP92 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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