Protein–RNA interactions for Protein: Q3THK3

Gtf2f1, General transcription factor IIF subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2f1Q3THK3 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf2f1Q3THK3 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf2f1Q3THK3 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf2f1Q3THK3 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf2f1Q3THK3 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf2f1Q3THK3 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf2f1Q3THK3 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf2f1Q3THK3 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf2f1Q3THK3 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf2f1Q3THK3 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf2f1Q3THK3 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf2f1Q3THK3 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf2f1Q3THK3 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf2f1Q3THK3 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf2f1Q3THK3 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2f1Q3THK3 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2f1Q3THK3 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2f1Q3THK3 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2f1Q3THK3 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2f1Q3THK3 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2f1Q3THK3 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2f1Q3THK3 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2f1Q3THK3 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2f1Q3THK3 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2f1Q3THK3 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2f1Q3THK3 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2f1Q3THK3 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2f1Q3THK3 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2f1Q3THK3 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2f1Q3THK3 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2f1Q3THK3 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2f1Q3THK3 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2f1Q3THK3 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2f1Q3THK3 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2f1Q3THK3 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2f1Q3THK3 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2f1Q3THK3 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2f1Q3THK3 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2f1Q3THK3 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2f1Q3THK3 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2f1Q3THK3 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2f1Q3THK3 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2f1Q3THK3 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2f1Q3THK3 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2f1Q3THK3 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2f1Q3THK3 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2f1Q3THK3 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2f1Q3THK3 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2f1Q3THK3 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2f1Q3THK3 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2f1Q3THK3 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2f1Q3THK3 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2f1Q3THK3 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2f1Q3THK3 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2f1Q3THK3 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf2f1Q3THK3 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf2f1Q3THK3 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf2f1Q3THK3 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf2f1Q3THK3 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf2f1Q3THK3 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf2f1Q3THK3 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf2f1Q3THK3 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf2f1Q3THK3 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf2f1Q3THK3 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf2f1Q3THK3 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf2f1Q3THK3 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf2f1Q3THK3 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf2f1Q3THK3 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf2f1Q3THK3 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf2f1Q3THK3 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf2f1Q3THK3 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf2f1Q3THK3 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf2f1Q3THK3 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf2f1Q3THK3 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf2f1Q3THK3 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf2f1Q3THK3 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf2f1Q3THK3 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf2f1Q3THK3 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf2f1Q3THK3 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf2f1Q3THK3 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf2f1Q3THK3 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf2f1Q3THK3 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf2f1Q3THK3 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf2f1Q3THK3 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf2f1Q3THK3 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf2f1Q3THK3 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf2f1Q3THK3 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf2f1Q3THK3 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf2f1Q3THK3 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf2f1Q3THK3 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf2f1Q3THK3 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf2f1Q3THK3 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf2f1Q3THK3 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gtf2f1Q3THK3 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gtf2f1Q3THK3 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gtf2f1Q3THK3 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gtf2f1Q3THK3 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gtf2f1Q3THK3 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gtf2f1Q3THK3 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gtf2f1Q3THK3 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms