Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cpne9Q1RLL3 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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