Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpusd3Q14AI6 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpusd3Q14AI6 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpusd3Q14AI6 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpusd3Q14AI6 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpusd3Q14AI6 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpusd3Q14AI6 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpusd3Q14AI6 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpusd3Q14AI6 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpusd3Q14AI6 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpusd3Q14AI6 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpusd3Q14AI6 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpusd3Q14AI6 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpusd3Q14AI6 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpusd3Q14AI6 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpusd3Q14AI6 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpusd3Q14AI6 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpusd3Q14AI6 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpusd3Q14AI6 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpusd3Q14AI6 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpusd3Q14AI6 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpusd3Q14AI6 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpusd3Q14AI6 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpusd3Q14AI6 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpusd3Q14AI6 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpusd3Q14AI6 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpusd3Q14AI6 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpusd3Q14AI6 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpusd3Q14AI6 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpusd3Q14AI6 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpusd3Q14AI6 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpusd3Q14AI6 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpusd3Q14AI6 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpusd3Q14AI6 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpusd3Q14AI6 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpusd3Q14AI6 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpusd3Q14AI6 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpusd3Q14AI6 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpusd3Q14AI6 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpusd3Q14AI6 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpusd3Q14AI6 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rpusd3Q14AI6 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rpusd3Q14AI6 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rpusd3Q14AI6 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rpusd3Q14AI6 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rpusd3Q14AI6 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rpusd3Q14AI6 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rpusd3Q14AI6 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rpusd3Q14AI6 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rpusd3Q14AI6 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rpusd3Q14AI6 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rpusd3Q14AI6 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rpusd3Q14AI6 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rpusd3Q14AI6 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rpusd3Q14AI6 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rpusd3Q14AI6 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rpusd3Q14AI6 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms