Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Traf3ip1Q149C2 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Traf3ip1Q149C2 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Traf3ip1Q149C2 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Traf3ip1Q149C2 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Traf3ip1Q149C2 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf3ip1Q149C2 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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