Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms