Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Atp2b3Q0VF55 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp2b3Q0VF55 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms