Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms