Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms