Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnn2Q08093 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnn2Q08093 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnn2Q08093 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnn2Q08093 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnn2Q08093 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnn2Q08093 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Cnn2Q08093 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Cnn2Q08093 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Cnn2Q08093 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Cnn2Q08093 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnn2Q08093 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Cnn2Q08093 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Cnn2Q08093 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnn2Q08093 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnn2Q08093 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Cnn2Q08093 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Cnn2Q08093 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Cnn2Q08093 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Cnn2Q08093 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Cnn2Q08093 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms