Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Gm16044-201ENSMUST00000118475 450 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Gm8159-201ENSMUST00000163738 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Gm8297-201ENSMUST00000171636 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Gm43491-201ENSMUST00000197133 784 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Gm31135-202ENSMUST00000208946 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 AC192616.3-201ENSMUST00000220797 1124 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Olfr19-201ENSMUST00000057886 1142 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Olfr898-201ENSMUST00000076504 951 ntAPPRIS P2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Zfp626-201ENSMUST00000080175 816 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Gm5458-201ENSMUST00000096121 997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Gm43216-201ENSMUST00000196295 1333 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Il12a-201ENSMUST00000029345 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Dcpp3-201ENSMUST00000115428 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 AW495222-202ENSMUST00000149839 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Lsm5-203ENSMUST00000176595 274 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Gm38006-201ENSMUST00000192421 697 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 9530003O04Rik-201ENSMUST00000192663 908 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Ssbp1-201ENSMUST00000031971 1063 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Olfr845-201ENSMUST00000071259 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Gm18300-201ENSMUST00000192792 1406 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Gm26724-201ENSMUST00000180434 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Gm45263-201ENSMUST00000210377 1375 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Cst8-202ENSMUST00000109947 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Gm25025-201ENSMUST00000175018 111 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Zcchc10-201ENSMUST00000018383 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Gm21089-201ENSMUST00000215843 325 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms