Protein–RNA interactions for Protein: Q04857

Col6a1, Collagen alpha-1(VI) chain, mousemouse

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Length 1,025 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a1Q04857 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col6a1Q04857 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col6a1Q04857 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Col6a1Q04857 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col6a1Q04857 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Col6a1Q04857 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col6a1Q04857 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col6a1Q04857 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col6a1Q04857 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col6a1Q04857 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col6a1Q04857 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col6a1Q04857 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col6a1Q04857 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col6a1Q04857 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col6a1Q04857 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col6a1Q04857 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col6a1Q04857 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col6a1Q04857 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col6a1Q04857 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col6a1Q04857 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col6a1Q04857 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col6a1Q04857 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col6a1Q04857 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col6a1Q04857 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a1Q04857 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a1Q04857 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a1Q04857 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a1Q04857 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a1Q04857 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a1Q04857 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a1Q04857 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a1Q04857 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a1Q04857 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a1Q04857 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a1Q04857 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a1Q04857 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a1Q04857 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a1Q04857 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a1Q04857 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a1Q04857 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a1Q04857 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a1Q04857 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a1Q04857 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Col6a1Q04857 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a1Q04857 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a1Q04857 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a1Q04857 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a1Q04857 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a1Q04857 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a1Q04857 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a1Q04857 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a1Q04857 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a1Q04857 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a1Q04857 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a1Q04857 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a1Q04857 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a1Q04857 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a1Q04857 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a1Q04857 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a1Q04857 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a1Q04857 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a1Q04857 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a1Q04857 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a1Q04857 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a1Q04857 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a1Q04857 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Col6a1Q04857 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Col6a1Q04857 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a1Q04857 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a1Q04857 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a1Q04857 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a1Q04857 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a1Q04857 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a1Q04857 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a1Q04857 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a1Q04857 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a1Q04857 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a1Q04857 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a1Q04857 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a1Q04857 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a1Q04857 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a1Q04857 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a1Q04857 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a1Q04857 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a1Q04857 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a1Q04857 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a1Q04857 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a1Q04857 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a1Q04857 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a1Q04857 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a1Q04857 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a1Q04857 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a1Q04857 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a1Q04857 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a1Q04857 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a1Q04857 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a1Q04857 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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