Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ascl1Q02067 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms