Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms