Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms