Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms