Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psme1P97371 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Psme1P97371 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Psme1P97371 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psme1P97371 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psme1P97371 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psme1P97371 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psme1P97371 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Psme1P97371 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psme1P97371 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psme1P97371 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psme1P97371 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psme1P97371 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psme1P97371 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psme1P97371 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psme1P97371 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psme1P97371 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psme1P97371 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psme1P97371 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psme1P97371 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psme1P97371 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psme1P97371 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psme1P97371 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psme1P97371 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psme1P97371 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Psme1P97371 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psme1P97371 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psme1P97371 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Psme1P97371 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psme1P97371 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psme1P97371 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psme1P97371 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psme1P97371 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psme1P97371 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psme1P97371 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Psme1P97371 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psme1P97371 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psme1P97371 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Psme1P97371 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psme1P97371 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psme1P97371 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psme1P97371 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psme1P97371 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psme1P97371 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psme1P97371 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psme1P97371 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psme1P97371 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psme1P97371 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psme1P97371 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psme1P97371 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Psme1P97371 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psme1P97371 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psme1P97371 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psme1P97371 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Psme1P97371 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psme1P97371 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psme1P97371 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psme1P97371 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psme1P97371 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psme1P97371 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Psme1P97371 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Psme1P97371 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Psme1P97371 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Psme1P97371 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psme1P97371 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psme1P97371 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psme1P97371 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psme1P97371 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psme1P97371 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psme1P97371 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psme1P97371 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psme1P97371 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psme1P97371 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Psme1P97371 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psme1P97371 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Psme1P97371 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psme1P97371 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psme1P97371 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psme1P97371 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psme1P97371 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psme1P97371 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Psme1P97371 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psme1P97371 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psme1P97371 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psme1P97371 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psme1P97371 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psme1P97371 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psme1P97371 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psme1P97371 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psme1P97371 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psme1P97371 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psme1P97371 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psme1P97371 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psme1P97371 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psme1P97371 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psme1P97371 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psme1P97371 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psme1P97371 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psme1P97371 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psme1P97371 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms