Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

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Length 586 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Taf1bP97358 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Taf1bP97358 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Taf1bP97358 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Taf1bP97358 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Taf1bP97358 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Taf1bP97358 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Taf1bP97358 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Taf1bP97358 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Taf1bP97358 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Taf1bP97358 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Taf1bP97358 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Taf1bP97358 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Taf1bP97358 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Taf1bP97358 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Taf1bP97358 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Taf1bP97358 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Taf1bP97358 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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