Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms