Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tubg1P83887 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms