Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gabpb2P81069 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gabpb2P81069 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gabpb2P81069 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms